|
|
Analysis of Genomic Data with the Assistance of Algorithm BLAST
Křížová, Martina ; Burgetová, Ivana (referee) ; Jaša, Petr (advisor)
This Bachelor Thesis describes analysis of genomic data with assistance of algorithm BLAST. In theoretic part, it describes genomes, their importance and structure. In this thesis, you can find a description of algorithm BLAST, Smith-Waterman and Needleman-Wunsch and with algorithm BLAST connected Karlin-Altschul statistics. This thesis is discussing types of databases such as spatial, deductive and relational which store genomic data. Second part is concerned with design and implementation of application which use mentioned algorithm and database Oracle 10g R2. Testing and confrontation output of algorithm is also a part of this work.
|
|
|
Implementation of External Authentication Modules for nginx
Kameníčková, Petra ; Očenášek, Pavel (referee) ; Rychlý, Marek (advisor)
This bachelor's thesis describes the process of design and development of authentication modules for nginx web server. These modules are used for enrollment of nginx-based applications and services into FreeIPA environment. The first part of the thesis explains the basics of FreeIPA and nginx architectures and principles of Kerberos and PAM authentication mechanisms as well. The second part of the thesis solves the practical problems - existing Apache modules analysis, nginx design description and implementation details. The last part describes confi guration requirements and possible enhancements.
|
|
|
Determination genetics differencies using alignment signal of biological sequences DNA
Trněný, Ondřej ; Provazník, Ivo (referee) ; Valla, Martin (advisor)
Biological sequences are constantly evolving so there are mutations, deletions and inserts. Because of need to classify these sequences and determine degree of their similarity have been developed aligment methods. For example Dot matrix or algorithms like Needleman-Wunsch and Smith-Waterman used for global and local alignment. These methods can be considered as conservative and are limited because it is assumed that although there have been changes during evolution they still preserve small distance between similar regions. Therefore number of methods have been proposed to eliminate these limitations by comparing sequences without alignment. These methods for example Words in sequences, Euklidean distance or Universal sequence maps are designed to eliminate limitations of alignment using methods.
|
|
|
Logging onto OS UNIX Using Mifare Smart Cards
Krempa, Peter ; Nagy, Jan (referee) ; Hanáček, Petr (advisor)
This thessis discusses the use of contactless smart card technology for authentication in an Linux desktop environment. It summarizes the advantages and imperfections of the technology and suggests its other possible uses. The paper describes the methods of authentication, and software designed for logging in and session locking, using Mifare smart cards.
|
|
|
Clustering of Protein Sequences Based on Primary Structure of Proteins
Jurásek, Petr ; Stryka, Lukáš (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor)
This master's thesis consider clustering of protein sequences based on primary structure of proteins. Studies the protein sequences from they primary structure. Describes methods for similarities in the amino acid sequences of proteins, cluster analysis and clustering algorithms. This thesis presents concept of distance function based on similarity of protein sequences and implements clustering algorithms ANGES, k-means, k-medoids in Python programming language.
|
|
|
Support for RADIUS Protocol in SSSD
Hujňák, Ondřej ; Očenášek, Pavel (referee) ; Zelený, Jan (advisor)
Moderní trendy ve správě uživatelů ve firemních prostředích směřují k centralizovaným řešením jako je LDAP či Active Directory. Ověřování uživatelů vůči těmto úložištím v Unix-like systémech je dostupné buď přes PAM moduly, nebo nově i přes bezpečnostní démon SSSD. Tato práce analyzuje využití RADIUS protokolu pro ověřování uživatelů a v rámci práce byl vyvinut modul do SSSD umožňující využití tohoto protokolu.
|
|
|
Unified Network Authentication for Linux
Zůna, Pavel ; Drozd, Michal (referee) ; Mlích, Jozef (advisor)
Tato práce se zabývá návrhem a implementací řešení pro jednotnou síťovou autentizaci pro operační systém Linux založeného na integraci systémových démonů WinBind a SSSD. Cílem je navrhnout takové řešení, které umožní autentizaci Linuxových klientů do domén spravovaných adresářovými službami Windows Active Directory a domén spravovaných adresářovými službami dostupnými na Linuxu současně. První dvě kapitoly seznámí čtenáře s autentizačními mechanizmy a technologiemi, které se pro tyto účely použivají na operačních systémech Windows a Linux. Třetí kapitola se zabývá jádrem práce a vysvětluje rozhodnutí učiněná při návrhu implementovaného řešení. Samotná implementace je pak popsána v kapitole čtyři. Poslední kapitoly popisují experimenty a testování pro vybrané případy užití s návrhy a popisem možných rozšíření do budoucna.
|
|
|
Implementation of NIS Backend for SSSD
Nykrýn, Lukáš ; Burget, Radek (referee) ; Zelený, Jan (advisor)
Tato práce se v první části zabývá představením technologií a nástrojů pro centrální správu a přihlašování uživatelů v GNU/Linux. Ukazuje využití adresářových služeb v síťové infrastruktuře, konkrétně služby NIS a její porovnání s dnes pravděpodobně nejrozšířenější adresářovou službou LDAP. Dále práce popisuje proces autentizace na klientských stanicích, konkrétně použití PAM a NSS a možné rozšíření celého systému zavedením cache díky démonu SSSD. Druhá část popisuje návrh a implementaci NIS provideru pro SSSD.
|
|
|
Support for Fingerprint Authentication
Bartoň, Jaroslav ; Beran, Vítězslav (referee) ; Mlích, Jozef (advisor)
The goal of the thesis is the finger-print authentication support within the Linux operating system and the K Desktop Environment (KDE). Theoretical part of the thesis firstly explains main IT security terms and ways to proof the identity. Secondly it describes biometric systems and types of processed biometric characteristics. Lastly the features of finger-prints, their markants as well as types of scanners used in scanning the finger-prints and ways to analyze the scanned material have been elaborated. Practical solution part of the thesis develops and establishes finger-print management application and plugin for KDM graphics login manager.
|
|
|
Psychoacoustic model of human hearing
Lepa, Ondřej ; Smékal, Zdeněk (referee) ; Sysel, Petr (advisor)
This thesis deals with human auditory system and psychoacoustics. Deals with psychoacoustic model of standard MPEG following the norm ISO/IEC 13818-3, Information technology - Generic coding of moving pictures and associated audio information Part 3: Audio. Closer look is given to determination of PAM, to methods of masking and what potential of masking it has. Next the simple computation of psychoacoustic values is~done in Matlab environment.
|
guest ::
